1971年,为响应周恩来总理“加强对慢支炎及肺心病防治”的号召,广州医科大学附属第一医院成立了“慢支炎防治小组”(团队研究成果1978年获得全国科学大会奖)。1979年“广州呼吸疾病研究所”在此基础上成立,成为国内最早的呼吸疾病研究机构之一。2017年8月,广州市机构编制委员会同意更名为“广州呼吸健康研究院”(下简称呼研院)。2018年,呼研院获批为公益二类事业单位,业务开展为科学研究及教学培训等项目。
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